I ceppi più resistenti sono caratterizzati da polimorfismo a singolo nucleotide (inglese Single Nucleotide Polymorphism, SNP). Questi SNP causano lo scambio di un aminoacido a livello dell'enzima enzima VKOR. Tali SNP sono dominanti e possono essere codificati sia omozigoti sia eterozigoti a livello del gene VKORC1, che ha un impatto solo secondario a livello di resistenza. Tutti i ceppi di ratto e topo resistenti noti ad oggi, caratterizzati da uno o più SNP, sono elencati in una tabella.
I meccanismi della resistenza e le mutazioni
Tabella 1. Polimorfismi a livello dell'enzima VKOR, noti come marcatori di resistenza. Non è incluso il ceppo di spretus-introgressione del topo domestico, marcato da una combinazione di polimorfismi (Arg12Trp/Ala26Ser/Ala48Thr/Arg61Leu).
Posizione dell'amminoacido alterato nel VKOR | Amminoacido wild type | Ceppo resistente all'amminoacido | Nome SNP e nome abbreviato | Specie |
---|---|---|---|---|
120 | Leucina | Glutammina | Leu120Gln L120Q |
R. norvegicus |
128 | Leucina | Glutammina | Leu128Gln L128Q |
R. norvegicus |
128 | Leucina | Serina | Leu128Ser L128S |
M. musculus |
139 | Tirosina | Cisteina | Tyr139Cys Y139C |
R. norvegicus, M. musculus, altre specie |
139 | Tirosina | Fenilalanina | Tyr139Phe Y139F |
R. norvegicus |
139 | Tirosina | Serina | Tyr139Ser Y139S |
R. norvegicus, M. musculus |